RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 PDE6BP35913 854 aa26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 TEX11Q8IYF3 940 aa26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 RHBDL3P58872 404 aa26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 IQCB1Q15051 598 aa26.33■■□□□ 1.81
PDE4D-223ENST00000515011 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.33■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 MMP10P09238 476 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 KAT14Q9H8E8 782 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ALDH1B1P30837 517 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 KRT2P35908 639 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 PLCD1P51178 756 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 FLT1P17948 1338 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 KIF5BP33176 963 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 SYKP43405 635 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 FOCADQ5VW36 1801 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 GTF2IP78347 998 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 MPNDQ8N594 471 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 RIMBP2O15034 1052 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 CLIC6Q96NY7 704 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 TSPY3P0CV98 308 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 TSPY8P0CW00 308 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 RASA1P20936 1047 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 PNMA1Q8ND90 353 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 MASTLQ96GX5 879 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 SNED1Q8TER0 1413 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 CABP5Q9NP86 173 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 PTPREP23469 700 aa26.28■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.28■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L3A6NCW0 530 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L4A6NCW7 530 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 SCG2P13521 617 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 GRM4Q14833 912 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 NPY5RQ15761 445 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 TNFRSF25Q93038 417 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 MYH1P12882 1939 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 OLFM4Q6UX06 510 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 A0A087WWV3 80 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 CDK8P49336 464 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF75DP51815 510 aa26.25■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.25■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 SARM1Q6SZW1 724 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 FAM205CA6NFA0 338 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM75PA6NK02 468 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 GNAQP50148 359 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 CERS5Q8N5B7 392 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TPM3P06753 285 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 MSL1Q68DK7 614 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 NLRP12P59046 1061 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 EYA3Q99504 573 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM5Q9C035 493 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.23■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 BECN2A8MW95 431 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 FBXW7Q969H0 707 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.22■■□□□ 1.79
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