RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK8P49336 464 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 FEZ1Q99689 392 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 SWAP70Q9UH65 585 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 EVI5LQ96CN4 794 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA3Q9UL41 463 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0D9SFI3 127 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PRG0 241 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMC4P43686 418 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 CABP5Q9NP86 173 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf81C9J6K1 198 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 OSBPP22059 807 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE4AP27815 886 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TDO2P48775 406 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF22Q14807 665 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM227BQ96M60 508 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 VCAM1P19320 739 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 SBK1Q52WX2 424 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS53Q5VIR6 699 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf42Q96LP6 360 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 APPP05067 770 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GNAT2P19087 354 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MYPNQ86TC9 1320 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ICA1Q05084 483 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKCZQ05513 592 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRQQ9UN88 632 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RASA1P20936 1047 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FCGRTP55899 365 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 HERVK_113P62684 666 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RILPL2Q969X0 211 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SRRDQ9UH36 339 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM1O75626 825 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC5Q96C12 935 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 USP14P54578 494 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NAPBQ9H115 298 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GNRH1P01148 92 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF6Q15052 776 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF333Q96JL9 665 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC17Q96LX7 622 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CNMDO75829 334 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PPARAQ07869 468 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 POTEFA5A3E0 1075 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L15C9J2P7 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L11C9JVI0 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L18D6R9N7 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L22D6RA61 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L19D6RCP7 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L20D6RJB6 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L24Q0WX57 530 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms