RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRFP10586 1907 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 EVX2Q03828 476 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 NAPBQ9H115 298 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 BCRP11274 1271 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 PRMT2P55345 433 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 FCGRTP55899 365 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 SH2D4AQ9H788 454 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF11Q86T75 865 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L15C9J2P7 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L11C9JVI0 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L18D6R9N7 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L22D6RA61 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L19D6RCP7 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L20D6RJB6 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 HIP1O00291 1037 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 AKR1B1P15121 316 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 GUCY1A2P33402 732 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE4BQ07343 736 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L24Q0WX57 530 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 ACER1Q8TDN7 264 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 C12orf42Q96LP6 360 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 MYH8P13535 1937 aa25.14■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP2B2Q01814 1243 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 ICA1Q05084 483 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM47Q96LD4 638 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 SMIM22K7EJ46 135 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 SDSP20132 328 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 RAET1EQ8TD07 263 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 COA7Q96BR5 231 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 SRRDQ9UH36 339 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 HERVK_113P62684 666 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM227BQ96M60 508 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 VCAM1P19320 739 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 PPARAQ07869 468 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 LPAR1Q92633 364 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 TMX2Q9Y320 296 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 MYPNQ86TC9 1320 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0D9SFI3 127 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 RASA1P20936 1047 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 CAP1Q01518 475 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 GOPCQ9HD26 462 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PRG0 241 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 ALX1Q15699 326 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD21O60216 631 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPY3P0CV98 308 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPY8P0CW00 308 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDM1O75626 825 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE4AP27815 886 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 CTGFP29279 349 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 COG2Q14746 738 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 VCPKMTQ9H867 229 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 SOX10P56693 466 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNA1P78396 465 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms