RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP5B	P32019	993 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP4	O75379	141 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CTGF	P29279	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF10A	O00220	468 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP10	Q12799	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	RFC5	P40937	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY3	O60266	1144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1G2	O75843	785 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2C8	P10632	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SZT2	Q5T011	3432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPC1	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE8B	O95263	885 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SGPL1	O95470	568 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZNB5	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL11	O14625	94 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	INHA	P05111	366 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ELN	P15502	786 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	FLT3LG	P49771	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SKOR1	P84550	965 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	BAP1	Q92560	729 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	BCR	P11274	1271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A1	P13866	664 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BP2	P78314	561 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SKAP2-209	ENST00000497511	DGAT1	O75907	488 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	NFIA	Q12857	509 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	COA7	Q96BR5	231 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN2	P17655	700 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MOGS	Q13724	837 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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