RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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SIMC1-208ENST00000495423 GH2P01242 217 aa28.2■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 ZAP70P43403 619 aa28.2■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.2■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.19■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.19■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L11C9JVI0 530 aa28.19■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L18D6R9N7 530 aa28.19■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L22D6RA61 530 aa28.19■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.19■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L19D6RCP7 530 aa28.19■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 USP17L20D6RJB6 530 aa28.19■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 CERS3Q8IU89 383 aa28.19■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.16■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 USP14P54578 494 aa28.16■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 FEZ1Q99689 392 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-208ENST00000495423 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.16■■■□□ 2.1
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SIMC1-208ENST00000495423 CYP2C19P33261 490 aa28.06■■■□□ 2.08
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SIMC1-208ENST00000495423 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-208ENST00000495423 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-208ENST00000495423 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SIMC1-208ENST00000495423 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SIMC1-208ENST00000495423 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.05■■■□□ 2.08
SIMC1-208ENST00000495423 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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