RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494058.5

SKIV2L-215, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 867 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-215ENST00000494058 EVX2Q03828 476 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 GRM1Q13255 1194 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 SEPT2Q15019 361 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 C8orf34Q49A92 452 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 NYAP2Q9P242 653 aa15.49■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 DOCK1Q14185 1865 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 LAMA4Q16363 1823 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 KDM4AO75164 1064 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 SLURP2P0DP57 97 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 BACE1P56817 501 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 ATP2B2Q01814 1243 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 SPP2Q13103 211 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 NEK1Q96PY6 1258 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 NBPF3Q9H094 633 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 GOPCQ9HD26 462 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 STX8Q9UNK0 236 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.48■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 TRIM75PA6NK02 468 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 B4E1Z4 1266 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 SMIM22K7EJ46 135 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 IRF6O14896 467 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 ALDH1A1P00352 501 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 DGKHQ86XP1 1220 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 TMTC2Q8N394 836 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 IL27Q8NEV9 243 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 LPAR1Q92633 364 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 KCNB2Q92953 911 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 MKL1Q969V6 931 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 MYH8P13535 1937 aa15.47■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 NEDD4P46934 1319 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 VEGFBP49765 207 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 CEP95Q96GE4 821 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 TMEM87BQ96K49 555 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 INCENPQ9NQS7 918 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 TMX2Q9Y320 296 aa15.46■□□□□ 0.07
SKIV2L-215ENST00000494058 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 TM4SF4P48230 202 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 FGD1P98174 961 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 CCL15Q16663 113 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 PNMA3Q9UL41 463 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 OTOFQ9HC10 1997 aa15.45■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 GUCY1A2P33402 732 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 JAG1P78504 1218 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 HTRA3P83110 453 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 MTMR2Q13614 643 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 C12orf42Q96LP6 360 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 KAT14Q9H8E8 782 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 CA12O43570 354 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 GJA5P36382 358 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 WTAPQ15007 396 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 ANKS1AQ92625 1134 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 VCPKMTQ9H867 229 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 TNKSO95271 1327 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 PRC1O43663 620 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 OSBPP22059 807 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-215ENST00000494058 NOVP48745 357 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms