RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	EVX2	Q03828	476 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	CTR9	Q6PD62	1173 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	FEZ1	Q99689	392 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	GPAA1	O43292	621 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE1A	P54750	535 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	SEPT2	Q15019	361 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	CDK8	P49336	464 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	HERVK_113	P62684	666 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	IRF5	Q13568	498 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	RAET1E	Q8TD07	263 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	FSD1	Q9BTV5	496 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L15	C9J2P7	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L11	C9JVI0	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L18	D6R9N7	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L22	D6RA61	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L19	D6RCP7	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L20	D6RJB6	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	PRKCZ	Q05513	592 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L24	Q0WX57	530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	ACER1	Q8TDN7	264 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	EVI5L	Q96CN4	794 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	GRK4	P32298	578 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	LBX2	Q6XYB7	198 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	COA7	Q96BR5	231 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607		M0R2C6	588 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	AKR1B1	P15121	316 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	VCAM1	P19320	739 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	SH2D4A	Q9H788	454 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A1W2PRG0	241 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	FLT3LG	P49771	235 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	LPAR1	Q92633	364 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	GABRQ	Q9UN88	632 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	POTEF	A5A3E0	1075 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	IGHD	P01880	384 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	TMX2	Q9Y320	296 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	PLXNB2	O15031	1838 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		27.89	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	RLF	Q13129	1914 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	BRCA2	P51587	3418 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	SMIM22	K7EJ46	135 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	NUCB1	Q02818	461 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	LNPK	Q9C0E8	428 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ERVK-9	P63128	1117 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ERVK-24	P63145	666 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ICA1	Q05084	483 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	PARP14	Q460N5	1801 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	ADCY3	O60266	1144 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	MAPK4	P31152	587 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	TDO2	P48775	406 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	UBXN2A	P68543	259 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A0G2JMZ2	1700 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	CAPN2	P17655	700 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	VCPKMT	Q9H867	229 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	APP	P05067	770 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	RASA1	P20936	1047 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SERBP1-208	ENST00000493607	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		27.83	■■■□□ 2.05

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