RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L11C9JVI0 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L18D6R9N7 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L22D6RA61 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L19D6RCP7 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L20D6RJB6 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PLCD1P51178 756 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L24Q0WX57 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 BCL11AQ9H165 835 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PEX10O60683 326 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 TRIB2Q92519 343 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 VCAM1P19320 739 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CYP2B6P20813 491 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 GABPAQ06546 454 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 EVI5O60447 810 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ATP5JP18859 108 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CCNA1P78396 465 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 GPR142Q7Z601 462 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 LCORLQ8N3X6 602 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PORCNQ9H237 461 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ALPK3Q96L96 1907 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 RGS2P41220 211 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 TRIM32Q13049 653 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 Q3C1V9 767 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ACER1Q8TDN7 264 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 APBA2Q99767 749 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 HAUS7Q99871 368 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 GUCY1A2P33402 732 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 ADD2P35612 726 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SEPT2Q15019 361 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 MORN1Q5T089 497 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 LBX2Q6XYB7 198 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 USP6NLQ92738 828 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 ARMT1Q9H993 441 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SWAP70Q9UH65 585 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 CNMDO75829 334 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 MBD4O95243 580 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 EVX2Q03828 476 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 CYP2D6P10635 497 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 MAP2K5Q13163 448 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 WDR78Q5VTH9 848 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 NBPF3Q9H094 633 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 UBE3CQ15386 1083 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SH2D4AQ9H788 454 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 PRKAB2O43741 272 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 CCL14Q16627 93 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 LPAR1Q92633 364 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-208ENST00000493601 PRO3102Q9H379 93 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms