RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 CMA1P23946 247 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 NOVP48745 357 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 MRIQ9BWK5 157 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 KIF5BP33176 963 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 GRM4Q14833 912 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 KAT14Q9H8E8 782 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 MYH8P13535 1937 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 PSME4Q14997 1843 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 JMYQ8N9B5 988 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 PNMA1Q8ND90 353 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 USP17L3A6NCW0 530 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 USP17L4A6NCW7 530 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 KINO60870 393 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 TSPY3P0CV98 308 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 TSPY8P0CW00 308 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 XBP1P17861 261 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 CHRNA5P30532 468 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 GABPAQ06546 454 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 NPY5RQ15761 445 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 HS1BP3Q53T59 392 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 MXD3Q9BW11 206 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 NDUFA8P51970 172 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 OXER1Q8TDS5 423 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 NR5A1Q13285 461 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 TNFRSF25Q93038 417 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 HPSEQ9Y251 543 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 A0A1B0GVL5 298 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 CUTAO60888 179 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 CAVIN2O95810 425 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 GNAQP50148 359 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 DACT2Q5SW24 774 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 FBXW7Q969H0 707 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 TEKT1Q969V4 418 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SCG2P13521 617 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 F8W031 263 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 G3V3G9 751 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 KRT2P35908 639 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 RESP18Q5W5W9 173 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 ECE2O60344 883 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 PFKFB1P16118 471 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SHC4Q6S5L8 630 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 TIGD1Q96MW7 591 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 USP40Q9NVE5 1235 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SIPA1L1O43166 1804 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 BAG6P46379 1132 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 PTPREP23469 700 aa22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 CRKP46108 304 aa22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 SCNN1DP51172 638 aa22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NELFE-211ENST00000492185 ZNF202O95125 648 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms