RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 NAPBQ9H115 298 aa32.05■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SH2D4AQ9H788 454 aa32.05■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa32.05■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa32.04■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 BCRP11274 1271 aa32.03■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa32.03■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ADGRA2Q96PE1 1338 aa32.02■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
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CCZ1B-211ENST00000486840 STK11IPQ8N1F8 1099 aa32.02■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa32.02■■■□□ 2.72
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CCZ1B-211ENST00000486840 PHIPQ8WWQ0 1821 aa32.01■■■□□ 2.72
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CCZ1B-211ENST00000486840 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa32.01■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa32.01■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 RAET1EQ8TD07 263 aa32.01■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 EMILIN3Q9NT22 766 aa32.01■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L15C9J2P7 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L13C9JLJ4 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L11C9JVI0 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L18D6R9N7 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L22D6RA61 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L17D6RBQ6 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L19D6RCP7 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L20D6RJB6 530 aa32■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 ICA1Q05084 483 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 USP17L24Q0WX57 530 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM110CQ1W6H9 321 aa32■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 AKR1B1P15121 316 aa31.99■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 ACER1Q8TDN7 264 aa31.99■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 COA7Q96BR5 231 aa31.99■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 OSBPL3Q9H4L5 887 aa31.99■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 KANSL2Q9H9L4 492 aa31.99■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 PDE4BQ07343 736 aa31.98■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM47Q96LD4 638 aa31.98■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 C12orf42Q96LP6 360 aa31.98■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa31.97■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.97■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 MYPNQ86TC9 1320 aa31.97■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 HIP1O00291 1037 aa31.96■■■□□ 2.71
CCZ1B-211ENST00000486840 GUCY1A2P33402 732 aa31.96■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 HERVK_113P62684 666 aa31.96■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM106CQ9BVX2 250 aa31.95■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa31.95■■■□□ 2.71
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CCZ1B-211ENST00000486840 RAD21O60216 631 aa31.94■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 VCAM1P19320 739 aa31.93■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 LPAR1Q92633 364 aa31.93■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 PAGR1Q9BTK6 254 aa31.93■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 TANGO6Q9C0B7 1094 aa31.93■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
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CCZ1B-211ENST00000486840 GOPCQ9HD26 462 aa31.92■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 LOC285556D6RIA3 1793 aa31.91■■■□□ 2.7
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CCZ1B-211ENST00000486840 CAP1Q01518 475 aa31.91■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 PPARAQ07869 468 aa31.91■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM227BQ96M60 508 aa31.91■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 SDSP20132 328 aa31.9■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNA1P78396 465 aa31.9■■■□□ 2.7
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CCZ1B-211ENST00000486840 HOXC10Q9NYD6 342 aa31.9■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 TMX2Q9Y320 296 aa31.9■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1W2PRG0 241 aa31.89■■■□□ 2.7
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CCZ1B-211ENST00000486840 EEF2P13639 858 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
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CCZ1B-211ENST00000486840 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 MORF4L1Q9UBU8 362 aa31.89■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 ROBO3Q96MS0 1386 aa31.89■■■□□ 2.7
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM1O75626 825 aa31.88■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 CTGFP29279 349 aa31.88■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 GRK4P32298 578 aa31.88■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKCZQ05513 592 aa31.88■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 VCPKMTQ9H867 229 aa31.88■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A0D9SFI3 127 aa31.87■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 UBXN2AP68543 259 aa31.87■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 COG2Q14746 738 aa31.87■■■□□ 2.69
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa31.87■■■□□ 2.69
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