RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MIPEPQ99797 713 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 VAV3Q9UKW4 847 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC2Q92887 1545 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SORBS3O60504 671 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CD8BP10966 210 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC3P19447 782 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 GRK4P32298 578 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CD96P40200 585 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CBLL1Q75N03 491 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 HID1Q8IV36 788 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 FOXQ1Q9C009 403 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 EOMESO95936 686 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CRELD1Q96HD1 420 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TIAM1Q13009 1591 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 F6X3S4 739 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SLITRK5O94991 958 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CTSHP09668 335 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ITGAEP38570 1179 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 NKG7Q16617 165 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PGRP06401 933 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 FUT4P22083 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ASB11Q8WXH4 323 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 USP31Q70CQ4 1352 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ITGB5P18084 799 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PDE4BQ07343 736 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 IKZF1Q13422 519 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 GFRA2O00451 464 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 BPNT1O95861 308 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CAP2P40123 477 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 CLCN7P51798 805 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 PHC3Q8NDX5 983 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 ASXL2Q76L83 1435 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 BIN1O00499 593 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K1Q13233 1512 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD4AQ8N468 514 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 KIF14Q15058 1648 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PRR33A8MZF0 331 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CBX7O95931 251 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PKN1Q16512 942 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 FBLN7Q53RD9 439 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 RELL1Q8IUW5 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM87BQ96K49 555 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 BCL11AQ9H165 835 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 NCOA2Q15596 1464 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.12□□□□□ -1.27
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