RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.22■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 POTEB2H3BUK9 544 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 GDF11O95390 407 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 PALD1Q9ULE6 856 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 MAP2K5Q13163 448 aa25.2■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.2■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 C12orf42Q96LP6 360 aa25.2■■□□□ 1.63
LTB-212ENST00000482429 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 HLA-DOAP06340 250 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 CCNA1P78396 465 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 GPR108Q9NPR9 543 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 CEP85Q6P2H3 762 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 MSCO60682 206 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 IGHDP01880 384 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 SNRKQ9NRH2 765 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 MYH1P12882 1939 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L15C9J2P7 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L11C9JVI0 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L18D6R9N7 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L22D6RA61 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L19D6RCP7 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L20D6RJB6 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 CNMDO75829 334 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP17L24Q0WX57 530 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 HOXC6P09630 235 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 LBX2Q6XYB7 198 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 GH2P01242 217 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 PTPREP23469 700 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 ATP8B2P98198 1209 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 LPAR1Q92633 364 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 GUCD1Q96NT3 240 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LTB-212ENST00000482429 USP14P54578 494 aa25.14■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 TNNI3KQ59H18 835 aa25.14■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.14■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 CERS3Q8IU89 383 aa25.14■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
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LTB-212ENST00000482429 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.14■■□□□ 1.61
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LTB-212ENST00000482429 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.13■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 EYSQ5T1H1 3165 aa25.12■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 LTBP2Q14767 1821 aa25.12■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 ATP2B2Q01814 1243 aa25.12■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 GRB14Q14449 540 aa25.12■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 EHD4Q9H223 541 aa25.12■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 IGHA2P01877 340 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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LTB-212ENST00000482429 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.11■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 RLFQ13129 1914 aa25.11■■□□□ 1.61
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LTB-212ENST00000482429 CNGA1P29973 690 aa25.09■■□□□ 1.61
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LTB-212ENST00000482429 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 BTBD7Q9P203 1132 aa25.09■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 RTP1P59025 263 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.08■■□□□ 1.61
LTB-212ENST00000482429 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LTB-212ENST00000482429 CYBAP13498 195 aa25.07■■□□□ 1.6
LTB-212ENST00000482429 CYP2C19P33261 490 aa25.07■■□□□ 1.6
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