RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	GH2	P01242	217 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CAP2	P40123	477 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	PRKG1	Q13976	671 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	INPP5B	P32019	993 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	LIFR	P42702	1097 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	NOV	P48745	357 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	MCM2	P49736	904 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	SEPT2	Q15019	361 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	PTPRF	P10586	1907 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ABCB7	O75027	752 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	LARGE1	O95461	756 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ICA1	Q05084	483 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	TTLL1	O95922	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ASNS	P08243	561 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	EVC	P57679	992 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	NID2	Q14112	1375 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ME3	Q16798	604 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	VGLL4	Q14135	290 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	BECN1	Q14457	450 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	MYH6	P13533	1939 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RNF13-208	ENST00000467996	ZBTB43	O43298	467 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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