RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	STOML1	Q9UBI4	398 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	HTRA3	P83110	453 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	MTMR3	Q13615	1198 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	IP6K1	Q92551	441 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RAX	Q9Y2V3	346 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	USP31	Q70CQ4	1352 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	PALLD	Q8WX93	1383 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936		A6NHS1	94 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	UNCX	A6NJT0	531 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	FSCN2	O14926	492 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	TRPA1	O75762	1119 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PCSK2	P16519	638 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PTPRA	P18433	802 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	EPHA1	P21709	976 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	MAPK1	P28482	360 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	FSTL1	Q12841	308 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	EDEM1	Q92611	657 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ASB16	Q96NS5	453 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PBX4	Q9BYU1	374 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PCNT	O95613	3336 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	NSD2	O96028	1365 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	MMP10	P09238	476 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ACPP	P15309	386 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	CES1	P23141	567 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	CABP4	P57796	275 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	COG3	Q96JB2	828 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	CEP41	Q9BYV8	373 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	NLRP12	P59046	1061 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	COL19A1	Q14993	1142 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	LTN1	O94822	1766 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	LY75	O60449	1722 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936		A0A0G2JLW4	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	NDUFB5	O43674	189 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	KIF4A	O95239	1232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	TGFB1	P01137	390 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	HOXC9	P31274	260 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	TGFB2	P61812	414 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM5	Q71RC9	77 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	CEP120	Q8N960	986 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CEP170-209	ENST00000464936	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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