RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 CPA4Q9UI42 421 aa13.93□□□□□ -0.18
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NISCH-204ENST00000464280 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
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NISCH-204ENST00000464280 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 VCPKMTQ9H867 229 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 GOPCQ9HD26 462 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.85□□□□□ -0.19
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