RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 TICAM2Q86XR7 235 aa20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC17Q96LX7 622 aa20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 GUCY1A2P33402 732 aa20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 SEPT2Q15019 361 aa20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF333Q96JL9 665 aa20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 MYPNQ86TC9 1320 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 CDK8P49336 464 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 EVI5LQ96CN4 794 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 LNPKQ9C0E8 428 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 M0R2C6 588 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 IGHDP01880 384 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 HERVK_113P62684 666 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 RAET1EQ8TD07 263 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ACER1Q8TDN7 264 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 BRCA2P51587 3418 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L15C9J2P7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L11C9JVI0 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L18D6R9N7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L22D6RA61 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L19D6RCP7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L20D6RJB6 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 NUCB1Q02818 461 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 USP17L24Q0WX57 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 SMIM22K7EJ46 135 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 AKR1B1P15121 316 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 VCAM1P19320 739 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 PRKCZQ05513 592 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 COA7Q96BR5 231 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 APPP05067 770 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 TDO2P48775 406 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 SH2D4AQ9H788 454 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1W2PRG0 241 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 GRK4P32298 578 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 ICA1Q05084 483 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 IRF5Q13568 498 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 GABRQQ9UN88 632 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 FLT3LGP49771 235 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 LBX2Q6XYB7 198 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 LPAR1Q92633 364 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 TMX2Q9Y320 296 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 POTEFA5A3E0 1075 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 ADCY3O60266 1144 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 RASA1P20936 1047 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 ERVK-9P63128 1117 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 ERVK-24P63145 666 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 NAPBQ9H115 298 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 MAPK4P31152 587 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 VCPKMTQ9H867 229 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms