RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 HLFQ16534 295 aa15.49■□□□□ 0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.072e-9■□□□□ 10.9
SGMS1-203ENST00000429490 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SGMS1-203ENST00000429490 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9.3
SGMS1-203ENST00000429490 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SGMS1-203ENST00000429490 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.46■□□□□ 0.07
SGMS1-203ENST00000429490 EXOC1Q9NV70 894 aa15.46■□□□□ 0.07
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