RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 FEZ1Q99689 392 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 NAPBQ9H115 298 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH7P12883 1935 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0D9SFI3 127 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP14P54578 494 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS53Q5VIR6 699 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PRG0 241 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXP2O15409 715 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf42Q96LP6 360 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMC4P43686 418 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 RASA1P20936 1047 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 CTGFP29279 349 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 PPARAQ07869 468 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC22Q5TAA0 569 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L15C9J2P7 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L11C9JVI0 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L18D6R9N7 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L22D6RA61 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L19D6RCP7 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L20D6RJB6 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 HIP1O00291 1037 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 GNRH1P01148 92 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ICA1Q05084 483 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L24Q0WX57 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ALX1Q15699 326 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM1O75626 825 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM47Q96LD4 638 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 TMX2Q9Y320 296 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.14■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 FGAP02671 866 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 VCAM1P19320 739 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXD10P28358 340 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE4BQ07343 736 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 FCGRTP55899 365 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 HERVK_113P62684 666 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP2B2Q01814 1243 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 SH2D4AQ9H788 454 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 PRMT2P55345 433 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 INCENPQ9NQS7 918 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 SRRDQ9UH36 339 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRFP10586 1907 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 VCPKMTQ9H867 229 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 PEX10O60683 326 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 TFAP4Q01664 338 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 LPAR1Q92633 364 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 NYAP2Q9P242 653 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.07■■□□□ 1.6
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