RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 CCP110O43303 1012 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 PLCD1P51178 756 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 MLKLQ8NB16 471 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 JAG2Q9Y219 1238 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 LRP5O75197 1615 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM75PA6NK02 468 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 NR1I3Q14994 352 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 SEC23AQ15436 765 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 PAGE5Q96GU1 130 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 BCORQ6W2J9 1755 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 GYS2P54840 703 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 ZBTB22O15209 634 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 STX10O60499 249 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 KCNQ4P56696 695 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GTH6 734 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 KLRK1P26718 216 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 KRT2P35908 639 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 MAP3K9P80192 1104 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 MYH8P13535 1937 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-204ENST00000409937 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CASP14P31944 242 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF384Q8TF68 577 aa16.02■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D8O95759 1140 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 FUT2Q10981 343 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CUL4BQ13620 913 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ESR2Q92731 530 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 DACH1Q9UI36 760 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 MTMR7Q9Y216 660 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NID2Q14112 1375 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CYP2D6P10635 497 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SLC51AQ86UW1 340 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 GNAT2P19087 354 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ATP6V1AP38606 617 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PTGDRQ13258 359 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NPY5RQ15761 445 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 BICDL1Q6ZP65 573 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NEK11Q8NG66 645 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA20Q8TB22 786 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 VPS16Q9H269 839 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CEP131Q9UPN4 1083 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 XDHP47989 1333 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 MCM7P33993 719 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ST5P78524 1137 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC152Q4G0S7 254 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TAB2Q9NYJ8 693 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ITPK1Q13572 414 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA1Q5VX52 437 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms