RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa39.21■■■■□ 3.87
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CSNK1E-204ENST00000403904 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa39.2■■■■□ 3.87
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC10A4Q96EP9 437 aa39.2■■■■□ 3.87
CSNK1E-204ENST00000403904 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
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CSNK1E-204ENST00000403904 USP17L5A8MUK1 530 aa39.18■■■■□ 3.86
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CSNK1E-204ENST00000403904 TTLL1O95922 423 aa39.14■■■■□ 3.86
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CSNK1E-204ENST00000403904 OPTNQ96CV9 577 aa39.14■■■■□ 3.86
CSNK1E-204ENST00000403904 ERICH2A1L162 156 aa39.13■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 SEC23AQ15436 765 aa39.13■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 CCDC178Q5BJE1 867 aa39.13■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 ACER1Q8TDN7 264 aa39.13■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 TMEM87BQ96K49 555 aa39.13■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 ECE1P42892 770 aa39.12■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 NOVP48745 357 aa39.12■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 A0A1W2PRG0 241 aa39.12■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 NEK4P51957 841 aa39.12■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 PPATQ06203 517 aa39.12■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 TTC14Q96N46 770 aa39.12■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 MTA3Q9BTC8 594 aa39.12■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 SENP2Q9HC62 589 aa39.12■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 LY9Q9HBG7 655 aa39.09■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 IRF6O14896 467 aa39.08■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 RABEP1Q15276 862 aa39.08■■■■□ 3.85
CSNK1E-204ENST00000403904 WNK4Q96J92 1243 aa39.08■■■■□ 3.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 TOP1P11387 765 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
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CSNK1E-204ENST00000403904 KAT14Q9H8E8 782 aa39.04■■■■□ 3.84
CSNK1E-204ENST00000403904 BACE1P56817 501 aa39.04■■■■□ 3.84
CSNK1E-204ENST00000403904 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
CSNK1E-204ENST00000403904 AGXT2Q9BYV1 514 aa39.04■■■■□ 3.84
CSNK1E-204ENST00000403904 SH2D4AQ9H788 454 aa39.04■■■■□ 3.84
CSNK1E-204ENST00000403904 PTPRFP10586 1907 aa39.03■■■■□ 3.84
CSNK1E-204ENST00000403904 HTRA3P83110 453 aa39.03■■■■□ 3.84
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