RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 FSD1Q9BTV5 496 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 IGHDP01880 384 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK8P49336 464 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP14P54578 494 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF11Q86T75 865 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 ACER1Q8TDN7 264 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF333Q96JL9 665 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 FEZ1Q99689 392 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 MYPNQ86TC9 1320 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 M0R2C6 588 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 GNAT2P19087 354 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 SBK1Q52WX2 424 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 LNPKQ9C0E8 428 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC17Q96LX7 622 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 HERVK_113P62684 666 aa24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 EVI5LQ96CN4 794 aa24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 AKR1B1P15121 316 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKCZQ05513 592 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 RAET1EQ8TD07 263 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PRG0 241 aa24.65■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.65■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.65■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 GABRQQ9UN88 632 aa24.65■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L15C9J2P7 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L11C9JVI0 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L18D6R9N7 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L22D6RA61 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L19D6RCP7 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L20D6RJB6 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 VCAM1P19320 739 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 NUCB1Q02818 461 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L24Q0WX57 530 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2E3-201ENST00000392415 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.64■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEFA5A3E0 1075 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 APPP05067 770 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 COA7Q96BR5 231 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 GRK4P32298 578 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 TDO2P48775 406 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 FLT3LGP49771 235 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 TICAM2Q86XR7 235 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 ICA1Q05084 483 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 IRF5Q13568 498 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 TMX2Q9Y320 296 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 PEX10O60683 326 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVK-9P63128 1117 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVK-24P63145 666 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 LBX2Q6XYB7 198 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 SH2D4AQ9H788 454 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 RASA1P20936 1047 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 Q3C1V9 767 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 LPAR1Q92633 364 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2E3-201ENST00000392415 ADCY3O60266 1144 aa24.58■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms