RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	RASSF10	A6NK89	507 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	MCM5	P33992	734 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	PPIL2	Q13356	520 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	IL17RA	Q96F46	866 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	OTUD5	Q96G74	571 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	WDR18	Q9BV38	432 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC102A	Q96A19	550 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	CEP95	Q96GE4	821 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	MTA3	Q9BTC8	594 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	SH2D4A	Q9H788	454 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	NYAP2	Q9P242	653 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	PCNT	O95613	3336 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	TTLL1	O95922	423 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC10A3	P09131	477 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GKAP1-204	ENST00000388782	ERICH2	A1L162	156 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	SPRYD7	Q5W111	196 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CXCL11	O14625	94 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	PRC1	O43663	620 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	NMT2	O60551	498 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ECE1	P42892	770 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	NOV	P48745	357 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM87B	Q96K49	555 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TTC14	Q96N46	770 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	FEZ1	Q99689	392 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	STX8	Q9UNK0	236 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TNKS	O95271	1327 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	GJA5	P36382	358 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ANTXR2	P58335	489 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ATP2B2	Q01814	1243 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	SPP2	Q13103	211 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TRIM75P	A6NK02	468 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L10	C9JJH3	530 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	IRF6	O14896	467 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	C19orf81	C9J6K1	198 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	RPS6KB1	P23443	525 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	USP14	P54578	494 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	SNAPC2	Q13487	334 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	RUFY3	Q7L099	469 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CHST3	Q7LGC8	479 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ACER1	Q8TDN7	264 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	MKL1	Q969V6	931 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TMX2	Q9Y320	296 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	MYH4	Q9Y623	1939 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	GTF2A2	P52657	109 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	BACE1	P56817	501 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	MTMR2	Q13614	643 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKS1A	Q92625	1134 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782	CAPNS2	Q96L46	248 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GKAP1-204	ENST00000388782		A0A1W2PRG0	241 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	WTAP	Q15007	396 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	SEC23A	Q15436	765 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms