RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEX11Q8IYF3 940 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNRKQ9NRH2 765 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L10C9JJH3 530 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMIM22K7EJ46 135 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNM1LO00429 736 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 COBLO75128 1261 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 GH2P01242 217 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAPN2P17655 700 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPREP23469 700 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 GUCY1A2P33402 732 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TLE2Q04725 743 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRE1Q14246 886 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE3AQ14432 1141 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR78Q5VTH9 848 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA5Q8NB90 893 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPM1EQ8WY54 764 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 LPAR1Q92633 364 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 COPRSQ9NQ92 184 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAI14Q9P0K7 980 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRCP08575 1304 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFRSF10AO00220 468 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB22O15209 634 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXC6P09630 235 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 VCAM1P19320 739 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJB2P25686 324 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC41Q15345 812 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PRG0 241 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYADML2A6NDP7 307 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASNSP08243 561 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADORA2AP29274 412 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLA2G5P39877 138 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.69□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.69□□□□□ -1.34
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RNU6-171P-201ENST00000384354 C12orf42Q96LP6 360 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADCY6O43306 1168 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PGK1P00558 417 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTGS1P23219 599 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHMT1P34896 483 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP2B2Q01814 1243 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TFF2Q03403 129 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 FEZ1Q99689 392 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PBX4Q9BYU1 374 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO3Q9UK99 471 aa6.68□□□□□ -1.34
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