RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 GCNT3O95395 438 aa23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM94Q12767 1356 aa23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ADORA1P30542 326 aa23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TEKT1Q969V4 418 aa23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 FAM170AA1A519 330 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 SPOPO43791 374 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TRPC3Q13507 836 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 VWA3BQ502W6 1294 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 CEP63Q96MT8 703 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MTMR6Q9Y217 621 aa23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MXRA7P84157 204 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 HDXQ7Z353 690 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP1Q9C000 1473 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 VAV2P52735 878 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 STX10O60499 249 aa23.48■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 BTDP43251 543 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF11Q86T75 865 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TPH2Q8IWU9 490 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TSC1Q92574 1164 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TAF12Q16514 161 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 CARD6Q9BX69 1037 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 STK24Q9Y6E0 443 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.47■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 SORBS3O60504 671 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 FGAP02671 866 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 PHKA1P46020 1223 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 SIK1P57059 783 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MTX1Q13505 466 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ZMYM6O95789 1325 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ADCY9O60503 1353 aa23.45■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TNKSO95271 1327 aa23.45■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 NR1I2O75469 434 aa23.45■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2B4P23634 1241 aa23.45■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 CALCOCO2Q13137 446 aa23.45■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ZEB2O60315 1214 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 AZI2Q9H6S1 392 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 NOD1Q9Y239 953 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC3O60645 756 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 PFKFB1P16118 471 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ABCA8O94911 1581 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 TECP42680 631 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 PFKFB2O60825 505 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 FANCBQ8NB91 859 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 HOOK2Q96ED9 719 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 BCS1LQ9Y276 419 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 24.4
SMURF1-201ENST00000361125 TUBBP07437 444 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 BLIDQ8IZY5 108 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 FBF1Q8TES7 1133 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 NUP58Q9BVL2 599 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 MNAT1P51948 309 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 TSPOAP1O95153 1857 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms