RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 LTKP29376 864 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 GUCY1A2P33402 732 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 NF2P35240 595 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PPARAQ07869 468 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 NDUFA10O95299 355 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 KRT31Q15323 416 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 WASF1Q92558 559 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PPFIA1Q13136 1202 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 IQCEQ6IPM2 695 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PLIN2Q99541 437 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SUFUQ9UMX1 484 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TRIM75PA6NK02 468 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 OPA1O60313 960 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 NAPBQ9H115 298 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ERCC3P19447 782 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ODF2Q5BJF6 829 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 XAGE2Q96GT9 111 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 EYA2O00167 538 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RPS6KA5O75582 802 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 MYBL2P10244 700 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SPA17Q15506 151 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RTN1Q16799 776 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 APPBP2Q92624 585 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 MAP3K14Q99558 947 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CABS1Q96KC9 395 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CEP83Q9Y592 693 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 OXER1Q8TDS5 423 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CD248Q9HCU0 757 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 KIF5AQ12840 1032 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 IFT88Q13099 833 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC114Q96M63 670 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PTPREP23469 700 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SCARF1Q14162 830 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 METTL24Q5JXM2 366 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 MED15Q96RN5 788 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 KCNJ18B7U540 433 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 KCNJ12Q14500 433 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CEP89Q96ST8 783 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 XBP1P17861 261 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 GUCY2FP51841 1108 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 NELFBQ8WX92 580 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 TRIM47Q96LD4 638 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 E2F5Q15329 346 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 NBPF14Q5TI25 921 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC51Q96ER9 411 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 MTMR7Q9Y216 660 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 FAM205CA6NFA0 338 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PAFAH1B1P43034 410 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CLGNO14967 610 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PRDM1O75626 825 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 KRT83P78385 493 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 PDIA6Q15084 440 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS2-201ENST00000359276 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms