RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
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GIPC1-201ENST00000345425 CEP95Q96GE4 821 aa32.68■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 TNKSO95271 1327 aa32.67■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 NMT2O60551 498 aa32.67■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR4Q9NYA4 1195 aa32.67■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 NEK4P51957 841 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 FGD1P98174 961 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 ICA1Q05084 483 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 TCEANC2Q96MN5 208 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 TTC14Q96N46 770 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 PDRG1Q9NUG6 133 aa32.66■■■□□ 2.82
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GIPC1-201ENST00000345425 USP17L5A8MUK1 530 aa32.65■■■□□ 2.82
GIPC1-201ENST00000345425 TTLL1O95922 423 aa32.65■■■□□ 2.82
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GIPC1-201ENST00000345425 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa32.64■■■□□ 2.82
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GIPC1-201ENST00000345425 FBXL16Q8N461 479 aa32.63■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 AS3MTQ9HBK9 375 aa32.63■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZUG5 572 aa32.63■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 CLMNQ96JQ2 1002 aa32.63■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 ELP3Q9H9T3 547 aa32.63■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa32.63■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 HUNKP57058 714 aa32.62■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 ANKS1AQ92625 1134 aa32.61■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 SLC10A4Q96EP9 437 aa32.61■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 ST18O60284 1047 aa32.6■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 ATP2B2Q01814 1243 aa32.6■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 RCSD1Q6JBY9 416 aa32.6■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 AGXT2Q9BYV1 514 aa32.6■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 LY9Q9HBG7 655 aa32.6■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 SAPCD2Q86UD0 394 aa32.6■■■□□ 2.81
GIPC1-201ENST00000345425 SH2D4AQ9H788 454 aa32.6■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa32.58■■■□□ 2.81
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GIPC1-201ENST00000345425 PPIL2Q13356 520 aa32.55■■■□□ 2.8
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GIPC1-201ENST00000345425 ECE1P42892 770 aa32.54■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 SPP2Q13103 211 aa32.54■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 PNMA1Q8ND90 353 aa32.54■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 SENP2Q9HC62 589 aa32.54■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
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GIPC1-201ENST00000345425 HHIPL1Q96JK4 782 aa32.53■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 CREBZFQ9NS37 354 aa32.53■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 RGMBQ6NW40 437 aa32.53■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa32.53■■■□□ 2.8
GIPC1-201ENST00000345425 CATIPQ7Z7H3 387 aa32.53■■■□□ 2.8
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