RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L11C9JVI0 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L18D6R9N7 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L22D6RA61 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L17D6RBQ6 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L19D6RCP7 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L20D6RJB6 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
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PPP4R4-202ENST00000328839 USP14P54578 494 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L24Q0WX57 530 aa30.39■■■□□ 2.46
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PPP4R4-202ENST00000328839 ACER1Q8TDN7 264 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 NBPF3Q9H094 633 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 PRO3102Q9H379 93 aa30.37■■■□□ 2.45
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PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.36■■■□□ 2.45
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PPP4R4-202ENST00000328839 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF532Q9HCE3 1301 aa30.36■■■□□ 2.45
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PPP4R4-202ENST00000328839 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 APBA2Q99767 749 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 C11orf49Q9H6J7 331 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 COG6Q9Y2V7 657 aa30.35■■■□□ 2.45
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PPP4R4-202ENST00000328839 CCL14Q16627 93 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 MORN1Q5T089 497 aa30.34■■■□□ 2.45
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PPP4R4-202ENST00000328839 USP6NLQ92738 828 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 STAP2Q9UGK3 403 aa30.34■■■□□ 2.45
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PPP4R4-202ENST00000328839 SEPT2Q15019 361 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 SDR42E1Q8WUS8 393 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4R4-202ENST00000328839 SZT2Q5T011 3432 aa30.32■■■□□ 2.44
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PPP4R4-202ENST00000328839 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
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PPP4R4-202ENST00000328839 GUCY1A2P33402 732 aa30.31■■■□□ 2.44
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PPP4R4-202ENST00000328839 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.28■■■□□ 2.44
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PPP4R4-202ENST00000328839 PTPREP23469 700 aa30.25■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SLFNL1Q499Z3 407 aa30.25■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 MFSD14CQ5VZR4 134 aa30.25■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 MBD4O95243 580 aa30.24■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.24■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 FLRT1Q9NZU1 646 aa30.24■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SWAP70Q9UH65 585 aa30.24■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 PRKAB2O43741 272 aa30.23■■■□□ 2.43
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