RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC69A6NI79 296 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SMIM22K7EJ46 135 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 PLCD1P51178 756 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 EVX2Q03828 476 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CHST3Q7LGC8 479 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 FAM151AQ8WW52 585 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 PFKFB2O60825 505 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CDK8P49336 464 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 PPP2R5BQ15173 497 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 ME3Q16798 604 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CSRNP1Q96S65 589 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 FZD1Q9UP38 647 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 KIF3AQ9Y496 699 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TSPY3P0CV98 308 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TSPY8P0CW00 308 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC17Q96LX7 622 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 MYH8P13535 1937 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CALM1P0DP23 149 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CALM2P0DP24 149 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CALM3P0DP25 149 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TFAP4Q01664 338 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 GABPAQ06546 454 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 APOBRQ0VD83 1088 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TCP10Q12799 353 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 RASA3Q14644 834 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 DGKHQ86XP1 1220 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 GTF3C6Q969F1 213 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 INCENPQ9NQS7 918 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 RNF186Q9NXI6 227 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 PRDM1O75626 825 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TRPA1O75762 1119 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 NUCB2P80303 420 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 LY9Q9HBG7 655 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 TNKSO95271 1327 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-201ENST00000324444 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 HOOK2Q96ED9 719 aa21.08■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB43O43298 467 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 CDKL5O76039 1030 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 RASA1P20936 1047 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 PDCP20941 246 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 ANKS1AQ92625 1134 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 TEPSINQ96N21 525 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.06■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 SEC23AQ15436 765 aa21.06■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.06■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 APOA5Q6Q788 366 aa21.06■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.06■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 CPLX1O14810 134 aa21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 STK3Q13188 491 aa21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K11Q16584 847 aa21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC18Q9H819 358 aa21.05■□□□□ 0.96
SYNE4-201ENST00000324444 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms