RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 SMIM5Q71RC9 77 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 CCDC172P0C7W6 258 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 MAGEA9P43362 315 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 GSDMDP57764 484 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 RAI14Q9P0K7 980 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 GUCY1A2P33402 732 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 BTAF1O14981 1849 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 H3BQF6 201 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 KCND1Q9NSA2 647 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 IKBKBO14920 756 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.96■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 PPARAQ07869 468 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 WTAPQ15007 396 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 CUTAO60888 179 aa22.95■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.95■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 FANCGO15287 622 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 EXOC4Q96A65 974 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 C8orf37Q96NL8 207 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 DEF6Q9H4E7 631 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 DNAI1Q9UI46 699 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 MMP1P03956 469 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 VPS72Q15906 364 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 CARD6Q9BX69 1037 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 WASF1Q92558 559 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 ERICH2A1L162 156 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 BTBD18B2RXH4 712 aa22.94■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 FOXN1O15353 648 aa22.94■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 RTN1Q16799 776 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.94■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.94■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 TOM1O60784 492 aa22.93■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 MNS1Q8NEH6 495 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 GRIN1Q05586 938 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 DPF2Q92785 391 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 HOMER1Q86YM7 354 aa22.92■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 NGLY1Q96IV0 654 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 NARFQ9UHQ1 456 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 MYH6P13533 1939 aa22.92■■□□□ 1.26
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HPS6-201ENST00000299238 NHSQ6T4R5 1651 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 NYXQ9GZU5 481 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 KLRK1P26718 216 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 RCAN1P53805 252 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 ZNF384Q8TF68 577 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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