RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.15■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.15■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 FLT3LGP49771 235 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED1-201ENST00000246139 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 APPBP2Q92624 585 aa25.13■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 CCL5P13501 91 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 OSBP2Q969R2 916 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L12C9JPN9 530 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L21D6R901 530 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 ADCY3O60266 1144 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP14P54578 494 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 HERVK_113P62684 666 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 UBXN2AP68543 259 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 C12orf60Q5U649 245 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 ACER1Q8TDN7 264 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 SWAP70Q9UH65 585 aa25.11■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 SEPT2Q15019 361 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 MYH7P12883 1935 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 GJB1P08034 283 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 GJA8P48165 433 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 CTR9Q6PD62 1173 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 FSD1Q9BTV5 496 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 RNF208Q9H0X6 261 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L15C9J2P7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L11C9JVI0 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L18D6R9N7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L22D6RA61 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L19D6RCP7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L20D6RJB6 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 ELNP15502 786 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 GUCY1A2P33402 732 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 USP17L24Q0WX57 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 C12orf42Q96LP6 360 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED1-201ENST00000246139 SMIM22K7EJ46 135 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 PEX10O60683 326 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 IGHDP01880 384 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 IRF5Q13568 498 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 STAP2Q9UGK3 403 aa25.07■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 M0R2C6 588 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 GPAA1O43292 621 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 CDK8P49336 464 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 PDE1AP54750 535 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 SMC5Q8IY18 1101 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 LNPKQ9C0E8 428 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 GNAT2P19087 354 aa25.05■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 VCAM1P19320 739 aa25.05■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.05■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.05■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 DPF3Q92784 378 aa25.05■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 INHAP05111 366 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 AKR1B1P15121 316 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 CCDC17Q96LX7 622 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 APPP05067 770 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 ERVK-9P63128 1117 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 ERVK-24P63145 666 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 Q3C1V9 767 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 SBK1Q52WX2 424 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 A0A1W2PRG0 241 aa25.02■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms