RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 FSTL1Q12841 308 aa23.56■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 DGKZQ13574 1117 aa23.56■■□□□ 1.36
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KDELR3-201ENST00000216014 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.56■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 PTPRAP18433 802 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 GJA5P36382 358 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 ECE1P42892 770 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 NOVP48745 357 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 LY9Q9HBG7 655 aa23.55■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 NEK4P51957 841 aa23.54■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 Q6ZUG5 572 aa23.54■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.54■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.54■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 PSMA5P28066 241 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 ASNSP08243 561 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 ICA1Q05084 483 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 CABP5Q9NP86 173 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-201ENST00000216014 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 AK2P54819 239 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 FKBP1BP68106 108 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 ATP2B2Q01814 1243 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 STX8Q9UNK0 236 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 HUNKP57058 714 aa23.5■■□□□ 1.35
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KDELR3-201ENST00000216014 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 CSADQ9Y600 493 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 HTRA3P83110 453 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 APOBRQ0VD83 1088 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 RABEP1Q15276 862 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 IQCA1Q86XH1 822 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 ANKS1AQ92625 1134 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 BRF1Q92994 677 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 OTUD5Q96G74 571 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 PICK1Q9NRD5 415 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 USP17L5A8MUK1 530 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 MYL10Q9BUA6 226 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.49■■□□□ 1.35
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KDELR3-201ENST00000216014 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 LARGE1O95461 756 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 SPP2Q13103 211 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 OPTNQ96CV9 577 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM87BQ96K49 555 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 NYAP2Q9P242 653 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM75PA6NK02 468 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 TTLL1O95922 423 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 WTAPQ15007 396 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 DGKHQ86XP1 1220 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 IRF6O14896 467 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 RXRAP19793 462 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 MKL1Q969V6 931 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 WDR18Q9BV38 432 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 MTMR7Q9Y216 660 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 DTNBO60941 627 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 MTMR2Q13614 643 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 FBXL16Q8N461 479 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 GINM1Q9NU53 330 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-201ENST00000216014 LIFRP42702 1097 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 APLP1P51693 650 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ERO1BQ86YB8 467 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 WNK4Q96J92 1243 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 TMX2Q9Y320 296 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 NT5C2P49902 561 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.45■■□□□ 1.34
KDELR3-201ENST00000216014 PNMA1Q8ND90 353 aa23.45■■□□□ 1.34
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