RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 DACH1Q9UI36 760 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 GLI3P10071 1580 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 MYH7P12883 1935 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NBPF26B4DH59 902 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 PTPREP23469 700 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 TRIM29Q14134 588 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NBPF14Q5TI25 921 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NBPF15Q8N660 670 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 GYPCP04921 128 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 FAM71BQ8TC56 605 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB43O43298 467 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA9P43362 315 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ERVK-24P63145 666 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 COBLO75128 1261 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CTAGE8P0CG41 777 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 SPATA20Q8TB22 786 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 LY9Q9HBG7 655 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 MEGF6O75095 1541 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 A0A087X0B3 334 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP25P42331 645 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CIAO1O76071 339 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CDC25AP30304 524 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 NR5A1Q13285 461 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ICE2Q659A1 982 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-222ENST00000639501 ATP2B1P20020 1258 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CUL4BQ13620 913 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 RNF40O75150 1001 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 MMP1P03956 469 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 AMPD2Q01433 879 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CSRNP2Q9H175 543 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.26■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 SPATA1Q5VX52 437 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 AFMP43652 599 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CORO7P57737 925 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 PIP4K2BP78356 416 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 DPYDQ12882 1025 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 APPP05067 770 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 FECHP22830 423 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 OXER1Q8TDS5 423 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 MCAMP43121 646 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TUBB2AQ13885 445 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CHRNA2Q15822 529 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 CYP27B1O15528 508 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-222ENST00000639501 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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