RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	RGS22	Q8NE09	1264 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	TEKT1	Q969V4	418 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	ZBTB7A	O95365	584 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	PPP2R5B	Q15173	497 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	CFAP45	Q9UL16	551 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
DNM1-222	ENST00000636280	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		18.52	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L3	A6NCW0	530 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L4	A6NCW7	530 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	GUCY1A2	P33402	732 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PICALM	Q13492	652 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	USP40	Q9NVE5	1235 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	DDAH1	O94760	285 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CALM1	P0DP23	149 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CALM2	P0DP24	149 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CALM3	P0DP25	149 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	RASA1	P20936	1047 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	KRT40	Q6A162	431 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CRK	P46108	304 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CDK8	P49336	464 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC93	Q567U6	631 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	USP28	Q96RU2	1077 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	KIF28P	B7ZC32	967 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CLCN1	P35523	988 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ATL3	Q6DD88	541 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	SYCE3	A1L190	88 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TSPY3	P0CV98	308 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TSPY8	P0CW00	308 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	DGKH	Q86XP1	1220 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	WASF1	Q92558	559 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	YDJC	A8MPS7	323 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	FUT2	Q10981	343 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	MRI	Q9BWK5	157 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	MYH1	P12882	1939 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	DEXI	O95424	95 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	BRAP	Q7Z569	592 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ANKS1A	Q92625	1134 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PGBD1	Q96JS3	809 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TRIM29	Q14134	588 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PSMD1	Q99460	953 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	KAT14	Q9H8E8	782 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	MRE11	P49959	708 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	NFIA	Q12857	509 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PANK2	Q9BZ23	570 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	MTFR1L	Q9H019	292 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	GABPA	Q06546	454 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	PNMA1	Q8ND90	353 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55

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