RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619831.4

DMD-229, Transcript of dystrophin, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 13,734 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-229	ENST00000619831	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TUBB	P07437	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PZP	P20742	1482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CHGB	P05060	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RASSF7	Q02833	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TESK2	Q96S53	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CYTH2	Q99418	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PTPRC	P08575	1304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CETN3	O15182	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KRT86	O43790	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SCRN1	Q12765	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831		M0R2C6	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831		B4DLN1	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KRT5	P13647	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CYP7A1	P22680	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MYH11	P35749	1972 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CDC25A	P30304	524 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CETN2	P41208	172 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PDE4D	Q08499	809 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CEP120	Q8N960	986 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DES	P17661	470 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TXK	P42681	527 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	POTED	Q86YR6	584 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DPF2	Q92785	391 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	VAV2	P52735	878 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ASIC2	Q16515	512 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	STMN2	Q93045	179 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CA8	P35219	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DMD-229	ENST00000619831	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms