RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 USP6NLQ92738 828 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 RAI14Q9P0K7 980 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 RGS2P41220 211 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 CCL14Q16627 93 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 C19orf81C9J6K1 198 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 POTEB2H3BUK9 544 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 ERVK-9P63128 1117 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 ERVK-24P63145 666 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 Q3C1V9 767 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 MORN1Q5T089 497 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 GPR142Q7Z601 462 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 GUCD1Q96NT3 240 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PORCNQ9H237 461 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 JAG1P78504 1218 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 APBA2Q99767 749 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-208ENST00000617055 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L10C9JJH3 530 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 GORABQ5T7V8 394 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 MEIS3Q99687 375 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 SLFN5Q08AF3 891 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 FAM161BQ96MY7 647 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 DNAJC18Q9H819 358 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 FOCADQ5VW36 1801 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 SRGAP3O43295 1099 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 GINM1Q9NU53 330 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 GDF11O95390 407 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 BAG3O95817 575 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 PLCG2P16885 1265 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 MCAMP43121 646 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 MAP2K5Q13163 448 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 FLT1P17948 1338 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2C-208ENST00000617055 LTBP2Q14767 1821 aa22.27■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 MTX1Q13505 466 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 PALD1Q9ULE6 856 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 PPP4CP60510 307 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 CCNA1P78396 465 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 CDH23Q9H251 3354 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 MSCO60682 206 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 CNMDO75829 334 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 GNAI3P08754 354 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 LPAR1Q92633 364 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 TTC28Q96AY4 2481 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 DNM1LO00429 736 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 CNGA1P29973 690 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 WDR78Q5VTH9 848 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 RLFQ13129 1914 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L15C9J2P7 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L11C9JVI0 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L18D6R9N7 530 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms