RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 RTEL1Q9NZ71 1219 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 DOCK2Q92608 1830 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXP2O15409 715 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 FGFR2P21802 821 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC25BP30305 580 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM29Q14134 588 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 STK38Q15208 465 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MSS51Q4VC12 460 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 JMYQ8N9B5 988 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 FSIP1Q8NA03 581 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PGBD1Q96JS3 809 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MTA3Q9BTC8 594 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT23Q9C075 422 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NAPBQ9H115 298 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ANO10Q9NW15 660 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 BCORQ6W2J9 1755 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 STK36Q9NRP7 1315 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 C4AP0C0L4 1744 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 C4BP0C0L5 1744 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PHKA1P46020 1223 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF165P49910 485 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TPM4P67936 248 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 USP28Q96RU2 1077 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM117AQ9C073 453 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CBX8Q9HC52 389 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NID2Q14112 1375 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 RCAN1P53805 252 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SIK1P57059 783 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ANTXR2P58335 489 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCA2AQ02747 115 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ADALQ6DHV7 355 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PI16Q6UXB8 463 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CHST3Q7LGC8 479 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SGMS1Q86VZ5 419 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 DRC7Q8IY82 874 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC102AQ96A19 550 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0G2JLW4 131 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ERICH2A1L162 156 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC69A6NI79 296 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA8AA7E2F4 631 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 BECN2A8MW95 431 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTLC2O15270 562 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB43O43298 467 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NEMFO60524 1076 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 DTNBO60941 627 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMTA2O94983 1202 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MBD4O95243 580 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 LIFRP42702 1097 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TDO2P48775 406 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SUSD4Q5VX71 490 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SARM1Q6SZW1 724 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 LUZP1Q86V48 1076 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP7D2Q96T17 732 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM5Q9C035 493 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SCN7AQ01118 1682 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms