RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591762.1

SPHK1-209, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPHK1, Length 2,502 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-209ENST00000591762 SEMA3EO15041 775 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 CDKL5O76039 1030 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 GYS1P13807 737 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 C4AP0C0L4 1744 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SPTLC2O15270 562 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 USP17L12C9JPN9 530 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 USP17L21D6R901 530 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 KRT40Q6A162 431 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SERPINB2P05120 415 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 CTR9Q6PD62 1173 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ERO1AQ96HE7 468 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF202O95125 648 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.852e-8■■■■□ 19.5
SPHK1-209ENST00000591762 GUCY1A2P33402 732 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 CHD4Q14839 1912 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ESR2Q92731 530 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 TNKSO95271 1327 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ADRA2BP18089 450 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 RTN1Q16799 776 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 BRAPQ7Z569 592 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-209ENST00000591762 YEATS4O95619 227 aa20.33■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 PFKFB1P16118 471 aa20.33■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.33■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.33■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 CYP2D6P10635 497 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 GPSM2P81274 684 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 GRIK5Q16478 980 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ATP1A3P13637 1013 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ANO1Q5XXA6 986 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 NLRP12P59046 1061 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ST5P78524 1137 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 TRIM29Q14134 588 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 NCAPHQ15003 741 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 PROM2Q8N271 834 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 XDHP47989 1333 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 IFNAR1P17181 557 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 TPM4P67936 248 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 SEC23AQ15436 765 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 TMTC2Q8N394 836 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 FANCBQ8NB91 859 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 KCND1Q9NSA2 647 aa20.31■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 KRT222Q8N1A0 295 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 DDR1Q08345 913 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.3■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 NMT2O60551 498 aa20.29■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 PTPN21Q16825 1174 aa20.29■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 TMEM51Q9NW97 253 aa20.29■□□□□ 0.84
SPHK1-209ENST00000591762 UFL1O94874 794 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms