RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP8B2P98198 1209 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNRD2Q9NNW7 524 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SURF6O75683 361 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NECAB2Q7Z6G3 386 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIB2Q92519 343 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RPTORQ8N122 1335 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PLXNB2O15031 1838 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 HERVK_113P62684 666 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKLE1Q8NAG6 615 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM34Q9BYJ4 488 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf81C9J6K1 198 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L10C9JJH3 530 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2B6P20813 491 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 STAP2Q9UGK3 403 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FOCADQ5VW36 1801 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-211ENST00000590874 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GINM1Q9NU53 330 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPC1 479 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP7A1P22680 504 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RBPJLQ9UBG7 517 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ALPK3Q96L96 1907 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF3O75054 1194 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DOAP06340 250 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEEQ6S8J3 1075 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf61Q8IZ16 206 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 EMILIN3Q9NT22 766 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 Q3C1V9 767 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SOCS4Q8WXH5 440 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT12Q9BQG2 462 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MIGA1Q8NAN2 632 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF3Q9H094 633 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PORCNQ9H237 461 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 OGDHLQ9ULD0 1010 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 IDH1O75874 414 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GH2P01242 217 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-9P63128 1117 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-24P63145 666 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RLBP1P12271 317 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK4P31152 587 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPRIPQ8IWB1 547 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGR1Q9BTK6 254 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf49Q9H6J7 331 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L2Q6R6M4 530 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 USP6NLQ92738 828 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 LRCH3Q96II8 777 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF15Q99988 308 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 USP5P45974 858 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE3AQ14432 1141 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TATDN1Q6P1N9 297 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR142Q7Z601 462 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB6Q8N7X4 407 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ANTXR1Q9H6X2 564 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL14Q16627 93 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MORN1Q5T089 497 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf42Q96LP6 360 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PFASO15067 1338 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SYN1P17600 705 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHH3Q7Z736 793 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FEZ1Q99689 392 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 EHD4Q9H223 541 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB13Q9UIV8 391 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CNMDO75829 334 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP8BP34820 402 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS2P41220 211 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CERS3Q8IU89 383 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMA3Q16787 3333 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP85Q6P2H3 762 aa31.25■■■□□ 2.59
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