RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 WDR18Q9BV38 432 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 ASNSP08243 561 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 BACE1P56817 501 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 DEFB118Q96PH6 123 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.81□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 CYP7A1P22680 504 aa14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 TRIM32Q13049 653 aa14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 PANK1Q8TE04 598 aa14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 GJD2Q9UKL4 321 aa14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.8□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.79□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 HMGCRP04035 888 aa14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 AACSQ86V21 672 aa14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 TRIB2Q92519 343 aa14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.78□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 USP17L10C9JJH3 530 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 GH2P01242 217 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 HLA-DOAP06340 250 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 HERVK_113P62684 666 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PRO3102Q9H379 93 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.77□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 C19orf81C9J6K1 198 aa14.76□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 IGSF3O75054 1194 aa14.76□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 EVX2Q03828 476 aa14.76□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.76□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 CYP2B6P20813 491 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 USP5P45974 858 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 Q3C1V9 767 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PORCNQ9H237 461 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 GINM1Q9NU53 330 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 ERVK-9P63128 1117 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 ERVK-24P63145 666 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 MAP3K12Q12852 859 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 EHD4Q9H223 541 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 RPTORQ8N122 1335 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 APBB1O00213 710 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 EVI5O60447 810 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 SHMT1P34896 483 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PLCD1P51178 756 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 ACER1Q8TDN7 264 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 C12orf42Q96LP6 360 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 FEZ1Q99689 392 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 CNMDO75829 334 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 PDE6AP16499 860 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 GUCY1A2P33402 732 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 CCL14Q16627 93 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 GPR142Q7Z601 462 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 CERS3Q8IU89 383 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 USP6NLQ92738 828 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 MYH8P13535 1937 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTIF-208ENST00000590422 RLFQ13129 1914 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms