RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	MAFG	O15525	162 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ABL1	P00519	1130 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NTF4	P34130	210 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ANAPC15	P60006	121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ORC1	Q13415	861 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	GRM2	Q14416	872 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	LRIG2	O94898	1065 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NME2	P22392	152 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	RING1	Q06587	406 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NDUFB5	O43674	189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SYN1	P17600	705 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	BMP7	P18075	431 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468		H3BS24	57 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ICMT	O60725	284 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SLITRK5	O94991	958 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	HPX	P02790	462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	FCGRT	P55899	365 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TRIM37	O94972	964 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	DLG4	P78352	724 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NFIX	Q14938	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	PEX10	O60683	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SEMA7A	O75326	666 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75

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