RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMC4P43686 418 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 SHMT1P34896 483 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 BACE1P56817 501 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM47Q96LD4 638 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 GINM1Q9NU53 330 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNMA3Q9UL41 463 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.41■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L10C9JJH3 530 aa21.41■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 MX1P20591 662 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OSBPP22059 807 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 GABPAQ06546 454 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FEZ1Q99689 392 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CABP5Q9NP86 173 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERC2O15083 957 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FCGRTP55899 365 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.4■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L12C9JPN9 530 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L21D6R901 530 aa21.39■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 C19orf81C9J6K1 198 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 FSD1Q9BTV5 496 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.37■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 C12orf60Q5U649 245 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.36■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF11Q86T75 865 aa21.35■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPAA1O43292 621 aa21.34■■□□□ 1.01
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