RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 TNFRSF1AP19438 455 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 AAMPQ13685 434 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 SYT8Q8NBV8 401 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2FQ969M7 185 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 BDH2Q9BUT1 245 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.78□□□□□ -1.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 NPR3P17342 541 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 USP5P45974 858 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 FGD1P98174 961 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 C14orf37Q86TY3 774 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 KCNB2Q92953 911 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ADAMTS10Q9H324 1103 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.77□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ABL1P00519 1130 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ESR1P03372 595 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 PPM1JQ5JR12 505 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SP8Q8IXZ3 490 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ABCB6Q9NP58 842 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SRRDQ9UH36 339 aa5.76□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 FZD6O60353 706 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 FAM13AO94988 1023 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SLITRK5O94991 958 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 VMACQ2NL98 169 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 GJD3Q8N144 294 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 EHD4Q9H223 541 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 MTMR7Q9Y216 660 aa5.75□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 LILRA2Q8N149 483 aa5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 MENTQ9BUN1 341 aa5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 IRAK3Q9Y616 596 aa5.74□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.73□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 MATN3O15232 486 aa5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 RTP5Q14D33 572 aa5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 STK35Q8TDR2 534 aa5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 CSADQ9Y600 493 aa5.72□□□□□ -1.49
FAM227B-211ENST00000560557 LRIG2O94898 1065 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 FSHBP01225 129 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 SERPINB4P48594 390 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 RING1Q06587 406 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 USTQ9Y2C2 406 aa5.71□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 GRIN3BO60391 1043 aa5.7□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 PDE6BP35913 854 aa5.7□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.7□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 NPHS2Q9NP85 383 aa5.7□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 PALD1Q9ULE6 856 aa5.7□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 H3BRB1 525 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 ICMTO60725 284 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 CILPO75339 1184 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 CBX7O95931 251 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 HMGA2P52926 109 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 NR0B2Q15466 257 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 FANCGO15287 622 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 EPHB3P54753 998 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 TNK2Q07912 1038 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 CREG2Q8IUH2 290 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 SULF2Q8IWU5 870 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 MIPEPQ99797 713 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 ARID3AQ99856 593 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.68□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 FITM1A5D6W6 292 aa5.67□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 WASH4PA8MWX3 477 aa5.67□□□□□ -1.5
FAM227B-211ENST00000560557 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms