RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	FKTN	O75072	461 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	ALDH1A1	P00352	501 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	SSH3	Q8TE77	659 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME2-208	ENST00000559359	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	IRF6	O14896	467 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	INPP5B	P32019	993 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	RGS3	P49796	1198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	MECOM	Q03112	1051 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CRHR2	Q13324	411 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CCL15	Q16663	113 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	DCAF15	Q66K64	600 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SPATA5	Q8NB90	893 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SNRK	Q9NRH2	765 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	GAK	O14976	1311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	MCAM	P43121	646 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	BTD	P43251	543 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SOX10	P56693	466 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	TNNI3K	Q59H18	835 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF384	Q8TF68	577 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	HOOK2	Q96ED9	719 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	GTF2A2	P52657	109 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	PICALM	Q13492	652 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ERO1B	Q86YB8	467 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	RAI14	Q9P0K7	980 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	GGCX	P38435	758 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CEP85	Q6P2H3	762 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	TRIM17	Q9Y577	477 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ENTPD3	O75355	529 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	NR1I2	O75469	434 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	PPIL2	Q13356	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	IDI2	Q9BXS1	227 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	GPR108	Q9NPR9	543 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	LAMB1	P07942	1786 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	BTBD19	C9JJ37	291 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	TLL1	O43897	1013 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CETP	P11597	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	RHBDL3	P58872	404 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CAP1	Q01518	475 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	SNAPC2	Q13487	334 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PSME2-208	ENST00000559359	FAM196B	A6NMK8	535 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PSME2-208	ENST00000559359	LDHC	P07864	332 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PSME2-208	ENST00000559359	ZAP70	P43403	619 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PSME2-208	ENST00000559359	RGS19	P49795	217 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PSME2-208	ENST00000559359	GSTO1	P78417	241 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PSME2-208	ENST00000559359	SP3	Q02447	781 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PSME2-208	ENST00000559359	PPAT	Q06203	517 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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