RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 SP110Q9HB58 689 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 H3BRB1 525 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 RAC2P15153 192 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 C12orf40Q86WS4 652 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 KCNN1Q92952 543 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 BCO2Q9BYV7 579 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 CSADQ9Y600 493 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 H3BS24 57 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 TTC6Q86TZ1 520 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 KCNC2Q96PR1 638 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 ENC1O14682 589 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 ESR1P03372 595 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP10-2P60368 255 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 MYLIPQ8WY64 445 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PEX10O60683 326 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 FGD1P98174 961 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PI16Q6UXB8 463 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 UBE2FQ969M7 185 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 FBRSQ9HAH7 460 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 KIR3DL1P43629 444 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 SERPINB4P48594 390 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 ERVFC1P60507 584 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 RASIP1Q5U651 963 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 RIN3Q8TB24 985 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 CBX8Q9HC52 389 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 SAMM50Q9Y512 469 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 CARNS1A5YM72 827 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 SEMA7AO75326 666 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PAGE1O75459 146 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 TNK2Q07912 1038 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 RETREG2Q8NC44 543 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 CEP44Q9C0F1 390 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PICK1Q9NRD5 415 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 DLG4P78352 724 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC14Q15048 493 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 NKG7Q16617 165 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 GAB4Q2WGN9 574 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 CXorf38Q8TB03 319 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 MIPEPQ99797 713 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 INPP5AQ14642 412 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 LILRA2Q8N149 483 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 RNF32Q9H0A6 362 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 GCM1Q9NP62 436 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 SYN1P17600 705 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 NR0B2Q15466 257 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-202ENST00000558300 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 BMP7P18075 431 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 CYP7A1P22680 504 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms