RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP6NLQ92738 828 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ASB2Q96Q27 587 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF576Q9H609 170 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 THEGQ9P2T0 379 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa3.57□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 FOCADQ5VW36 1801 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 RFX7Q2KHR2 1363 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 DNM1LO00429 736 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ENTPD3O75355 529 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PDE8BO95263 885 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 DNAJB2P25686 324 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ITGB8P26012 769 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 EPHB4P54760 987 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 HERVK_113P62684 666 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ERVK-9P63128 1117 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ERVK-24P63145 666 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MTMR2Q13614 643 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 Q3C1V9 767 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MORN1Q5T089 497 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 GPR142Q7Z601 462 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRPV1Q8NER1 839 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 IL27Q8NEV9 243 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 LPAR1Q92633 364 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 FERMT2Q96AC1 680 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 KAZALD1Q96I82 304 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SUCLG2Q96I99 432 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 APBA2Q99767 749 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 IDI2Q9BXS1 227 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PORCNQ9H237 461 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRDM12Q9H4Q4 367 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 METRNQ9UJH8 293 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRC37A2A6NM11 1700 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 UTYO14607 1347 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 KIF16BQ96L93 1317 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYH1P12882 1939 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L5A8MUK1 530 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 KBTBD13C9JR72 458 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC5A1P13866 664 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 RAG1P15918 1043 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 FGFR2P21802 821 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 IGFBP4P22692 258 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAPK4P31152 587 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 CYP2C19P33261 490 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 CAP2P40123 477 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 PBX2P40425 430 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 BACE1P56817 501 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATP2B2Q01814 1243 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 TFF2Q03403 129 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 TLE2Q04725 743 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 FPGSQ05932 587 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAP2K5Q13163 448 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADGRE1Q14246 886 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SNX17Q15036 470 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SH3D19Q5HYK7 790 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 WDR78Q5VTH9 848 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ANO1Q5XXA6 986 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3AP2-201ENST00000557014 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms