RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GDF11O95390 407 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BACE1P56817 501 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDE6AP16499 860 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CTGFP29279 349 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPATCH3Q96I76 525 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RNF208Q9H0X6 261 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EHD4Q9H223 541 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADCY3O60266 1144 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GH2P01242 217 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FLT3LGP49771 235 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GCC1Q96CN9 775 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DOCK1Q14185 1865 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP5JP18859 108 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCB5Q2M3G0 1257 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCL5P13501 91 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP14P54578 494 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNAJC18Q9H819 358 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GABRQQ9UN88 632 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IRF5Q13568 498 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MTFR1Q15390 333 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GJB1P08034 283 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HERVK_113P62684 666 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HAUS7Q99871 368 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 INHAP05111 366 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ELNP15502 786 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CAPN2P17655 700 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 JAG1P78504 1218 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L15C9J2P7 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L11C9JVI0 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L18D6R9N7 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L22D6RA61 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L19D6RCP7 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L20D6RJB6 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MBD4O95243 580 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAPK4P31152 587 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GJA8P48165 433 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLCD1P51178 756 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCNA1P78396 465 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L24Q0WX57 530 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCORLQ8N3X6 602 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DPF3Q92784 378 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARMT1Q9H993 441 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SWAP70Q9UH65 585 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADD2P35612 726 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMGCRP04035 888 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHMT1P34896 483 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBE3CQ15386 1083 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms