RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	SV2B	Q7L1I2	683 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	PREX2	Q70Z35	1606 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	ABCC1	P33527	1531 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM170B	A6NMN3	283 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	TSPOAP1	O95153	1857 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP26A1	O43174	497 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	CELA3A	P09093	270 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	TSPY4	P0CV99	314 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	TSPY10	P0CW01	314 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	ERCC3	P19447	782 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	LGR6	Q9HBX8	967 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	RNF19A	Q9NV58	838 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	KDM5C	P41229	1560 aa		6.52	□□□□□ -1.36
TCTN1-222	ENST00000549123	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	WNT11	O96014	354 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	NEFM	P07197	916 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	DAB2	P98082	770 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC27	Q2M243	656 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PARP2	Q9UGN5	583 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP10A	O60312	1499 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ABCC5	O15440	1437 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	RING1	Q06587	406 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ISL2	Q96A47	359 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ADAMTS4	O75173	837 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PRNP	P04156	253 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PSMD2	Q13200	908 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CDK5R2	Q13319	367 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PPM1J	Q5JR12	505 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	TMC4	Q7Z404	712 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CSAD	Q9Y600	493 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	RICTOR	Q6R327	1708 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	DAPK1	P53355	1430 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	FANCG	O15287	622 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM87A	P0C7U9	286 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	C12orf40	Q86WS4	652 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	PICK1	Q9NRD5	415 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
TCTN1-222	ENST00000549123	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37

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