RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, human

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-215	ENST00000546102	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KLF4	O43474	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ADAM11	O75078	769 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CES1	P23141	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	USP11	P51784	963 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	RAB33A	Q14088	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FBXO24	O75426	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FCGRT	P55899	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	RASA3	Q14644	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	EHD4	Q9H223	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ATP10B	O94823	1461 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	DNAJC6	O75061	913 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FOSL1	P15407	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SOX9	P48436	509 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	IKBKE	Q14164	716 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102		A0A1W2PP55	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	TM4SF5	O14894	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	CYP26A1	O43174	497 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	CDC45	O75419	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CUL3-215	ENST00000546102	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms