RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 FLT1P17948 1338 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 SLX4Q8IY92 1834 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CDKL5O76039 1030 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CYP2D6P10635 497 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 RPS6KB1P23443 525 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 RASA3Q14644 834 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 Q6ZUG5 572 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 GGA3Q9NZ52 723 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 KIF5BP33176 963 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 STK3Q13188 491 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM29Q14134 588 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 C12orf60Q5U649 245 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 BRF1Q92994 677 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 WNT10BO00744 389 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CALM1P0DP23 149 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CALM2P0DP24 149 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CALM3P0DP25 149 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CDK8P49336 464 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 PRKG1Q13976 671 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 MFSD10Q14728 455 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC96Q2M329 555 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 FAM83AQ86UY5 434 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 IDI2Q9BXS1 227 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CSADQ9Y600 493 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CHST3Q7LGC8 479 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 IFNL1Q8IU54 200 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZMYM6O95789 1325 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB43O43298 467 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 GNAQP50148 359 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 RHBDL3P58872 404 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 GMLQ99445 158 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 RRAGCQ9HB90 399 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 H3BQV1 296 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 XBP1P17861 261 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CAMK2BQ13554 666 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 IFFO2Q5TF58 517 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 POTEDQ86YR6 584 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ORC4O43929 436 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 NFIAQ12857 509 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 IL25Q9H293 177 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 SPEF2Q9C093 1822 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CASZ1Q86V15 1759 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 TAF1P21675 1872 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 CPA1P15085 419 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 AK2P54819 239 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 WASF1Q92558 559 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 PDCP20941 246 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 MCM6Q14566 821 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 MICU3Q86XE3 530 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRO-210ENST00000544244 RGS22Q8NE09 1264 aa6.61□□□□□ -1.35
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