RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 DDX11Q96FC9 970 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 KRT82Q9NSB4 513 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 USTQ9Y2C2 406 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 VAMP4O75379 141 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 STAM2O75886 525 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ATG7O95352 703 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 HSPA4P34932 840 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RARSP54136 660 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ERC1Q8IUD2 1116 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RGL1Q9NZL6 768 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CTNNA3Q9UI47 895 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CCDC122Q5T0U0 273 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CEP135Q66GS9 1140 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TBC1D5Q92609 795 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TMEM94Q12767 1356 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 MYBPC3Q14896 1274 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 FRS2Q8WU20 508 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 POM121Q96HA1 1249 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 FLT4P35916 1363 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 A0A1W2PRQ8 180 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TRAPPC10P48553 1259 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 Q4G0T1 1027 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SPECC1Q5M775 1068 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 EXOC4Q96A65 974 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SYNCQ9H7C4 482 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 AMPD3Q01432 767 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SVIPQ8NHG7 77 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ATG3Q9NT62 314 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CLCN2P51788 898 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TUBA1BP68363 451 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TUBA1AQ71U36 451 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 EYA1Q99502 592 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 ABCG4Q9H172 646 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SBNO1A3KN83 1393 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SSH2Q76I76 1423 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 DESP17661 470 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 HOXC9P31274 260 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RAB27AP51159 221 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 KAZNQ674X7 775 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TMC6Q7Z403 805 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TMC2Q8TDI7 906 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SPAG5Q96R06 1193 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 PPCSQ9HAB8 311 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TRIM17Q9Y577 477 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 CHL1O00533 1208 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 UBE4AQ14139 1066 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TEKT4Q8WW24 435 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 TSC1Q92574 1164 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 UROC1Q96N76 676 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-225ENST00000541295 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms